MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi169 chromosome

Total Repeats: 29595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017740	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	386751994
2	NC_017740	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	386751994
3	NC_017740	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751994
4	NC_017740	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386751994
5	NC_017740	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	386751994
6	NC_017740	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	386751994
7	NC_017740	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751994
8	NC_017740	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386751994
9	NC_017740	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386751994
10	NC_017740	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	386751994
11	NC_017740	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386751995
12	NC_017740	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	386751995
13	NC_017740	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386751995
14	NC_017740	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386751995
15	NC_017740	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	386751995
16	NC_017740	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751995
17	NC_017740	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	386751995
18	NC_017740	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751995
19	NC_017740	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	386751996
20	NC_017740	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751996
21	NC_017740	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386751996
22	NC_017740	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386751996
23	NC_017740	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	386751996
24	NC_017740	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	386751996
25	NC_017740	CTA	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751996
26	NC_017740	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	386751996
27	NC_017740	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	386751996
28	NC_017740	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386751996
29	NC_017740	CTTG	2	8	1456	1463	0 %	50 %	25 %	25 %	386751996
30	NC_017740	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	386751996
31	NC_017740	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	386751996
32	NC_017740	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386751996
33	NC_017740	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751996
34	NC_017740	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751996
35	NC_017740	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	386751997
36	NC_017740	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	386751997
37	NC_017740	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	386751997
38	NC_017740	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	386751997
39	NC_017740	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386751997
40	NC_017740	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	386751997
41	NC_017740	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	386751997
42	NC_017740	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	386751997
43	NC_017740	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386751997
44	NC_017740	T	6	6	3020	3025	0 %	100 %	0 %	0 %	386751997
45	NC_017740	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386751997
46	NC_017740	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386751997
47	NC_017740	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386751997
48	NC_017740	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	386751998
49	NC_017740	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	386751998
50	NC_017740	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	386751998
51	NC_017740	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386751998
52	NC_017740	TTG	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386751998
53	NC_017740	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751998
54	NC_017740	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	386751998
55	NC_017740	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	386751998
56	NC_017740	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386751998
57	NC_017740	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386751998
58	NC_017740	CAT	2	6	5440	5445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751999
59	NC_017740	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386751999
60	NC_017740	TCT	2	6	5507	5512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
61	NC_017740	GAAACC	2	12	5555	5566	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386751999
62	NC_017740	AAT	2	6	5605	5610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386751999
63	NC_017740	CTT	2	6	5613	5618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
64	NC_017740	TTCA	2	8	5683	5690	25 %	50 %	0 %	25 %	386751999
65	NC_017740	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751999
66	NC_017740	GC	3	6	5750	5755	0 %	0 %	50 %	50 %	386751999
67	NC_017740	ATG	2	6	5756	5761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751999
68	NC_017740	TCA	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751999
69	NC_017740	CCG	2	6	5834	5839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386751999
70	NC_017740	CTT	2	6	5853	5858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
71	NC_017740	TCA	2	6	5888	5893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751999
72	NC_017740	T	6	6	5902	5907	0 %	100 %	0 %	0 %	386751999
73	NC_017740	AG	3	6	5962	5967	50 %	0 %	50 %	0 %	386751999
74	NC_017740	TCTT	2	8	5977	5984	0 %	75 %	0 %	25 %	386751999
75	NC_017740	CAT	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386751999
76	NC_017740	GTG	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386751999
77	NC_017740	TTC	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
78	NC_017740	TAA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386751999
79	NC_017740	CCG	2	6	6188	6193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386751999
80	NC_017740	TTTCT	2	10	6219	6228	0 %	80 %	0 %	20 %	386751999
81	NC_017740	CAC	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386751999
82	NC_017740	GAT	2	6	6331	6336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751999
83	NC_017740	T	6	6	6363	6368	0 %	100 %	0 %	0 %	386751999
84	NC_017740	TAG	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386751999
85	NC_017740	T	7	7	6402	6408	0 %	100 %	0 %	0 %	386751999
86	NC_017740	GA	3	6	6479	6484	50 %	0 %	50 %	0 %	386751999
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89	NC_017740	T	6	6	6670	6675	0 %	100 %	0 %	0 %	386751999
90	NC_017740	T	6	6	6682	6687	0 %	100 %	0 %	0 %	386751999
91	NC_017740	TAA	2	6	6696	6701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386751999
92	NC_017740	AAGC	2	8	6792	6799	50 %	0 %	25 %	25 %	386751999
93	NC_017740	GCA	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386751999
94	NC_017740	CTT	2	6	6852	6857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386751999
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96	NC_017740	T	6	6	7105	7110	0 %	100 %	0 %	0 %	386752000
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98	NC_017740	TCT	2	6	7205	7210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386752000
99	NC_017740	CTT	2	6	7287	7292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386752000
100	NC_017740	GAT	3	9	7375	7383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386752000
101	NC_017740	TCT	2	6	7403	7408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386752000
102	NC_017740	CTA	2	6	7419	7424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386752000
103	NC_017740	GATA	2	8	7768	7775	50 %	25 %	25 %	0 %	386752001
104	NC_017740	TTG	2	6	7834	7839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752001
105	NC_017740	GAA	2	6	7850	7855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752001
106	NC_017740	TCAA	2	8	7875	7882	50 %	25 %	0 %	25 %	386752001
107	NC_017740	TTA	2	6	8029	8034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752001
108	NC_017740	AGA	2	6	8044	8049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752001
109	NC_017740	ACC	2	6	8052	8057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386752001
110	NC_017740	AAG	2	6	8085	8090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752001
111	NC_017740	T	8	8	8108	8115	0 %	100 %	0 %	0 %	386752001
112	NC_017740	ATT	2	6	8118	8123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752001
113	NC_017740	A	6	6	8127	8132	100 %	0 %	0 %	0 %	386752001
114	NC_017740	AG	3	6	8146	8151	50 %	0 %	50 %	0 %	386752001
115	NC_017740	CAT	2	6	8299	8304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386752001
116	NC_017740	GTG	2	6	8333	8338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386752001
117	NC_017740	ACAA	2	8	8457	8464	75 %	0 %	0 %	25 %	386752001
118	NC_017740	A	6	6	8582	8587	100 %	0 %	0 %	0 %	386752001
119	NC_017740	ATG	2	6	8613	8618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386752001
120	NC_017740	G	7	7	8684	8690	0 %	0 %	100 %	0 %	386752001
121	NC_017740	AAC	2	6	8705	8710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386752001
122	NC_017740	A	6	6	8755	8760	100 %	0 %	0 %	0 %	386752001
123	NC_017740	A	6	6	8878	8883	100 %	0 %	0 %	0 %	386752001
124	NC_017740	AG	3	6	8963	8968	50 %	0 %	50 %	0 %	386752001
125	NC_017740	AGA	2	6	9091	9096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386752001
126	NC_017740	TTG	2	6	9104	9109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752001
127	NC_017740	A	6	6	9152	9157	100 %	0 %	0 %	0 %	386752001
128	NC_017740	GAC	2	6	9191	9196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386752001
129	NC_017740	TTA	3	9	9212	9220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386752001
130	NC_017740	A	7	7	9238	9244	100 %	0 %	0 %	0 %	386752001
131	NC_017740	TTG	2	6	9269	9274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752001
132	NC_017740	GCTC	2	8	9318	9325	0 %	25 %	25 %	50 %	386752001
133	NC_017740	A	6	6	9336	9341	100 %	0 %	0 %	0 %	386752001
134	NC_017740	A	6	6	9352	9357	100 %	0 %	0 %	0 %	386752001
135	NC_017740	G	6	6	9439	9444	0 %	0 %	100 %	0 %	386752002
136	NC_017740	TGT	2	6	9455	9460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386752002
137	NC_017740	G	6	6	9523	9528	0 %	0 %	100 %	0 %	386752002
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139	NC_017740	AG	3	6	9601	9606	50 %	0 %	50 %	0 %	386752002
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